Untere Wasserbehörde ist die Kreisverwaltung, in kreisfreien Städten die Stadtverwaltung.
Die Landkreise und kreisfreien Städte nehmen die Aufgabe als Auftragsangelegenheit wahr.
Obere Wasserbehörde ist die Struktur- und Genehmigungsdirektion.
Oberste Wasserbehörde ist das für Wasserwirtschaft und Wasserrecht zuständige Ministerium.